Podemos encontrar el instalador en la [web de xilinx](https://www.xilinx.com/support/download/index.html/content/xilinx/en/downloadNav/design-tools/v2012_4---14_7.html "Instaladores Herramientas de Diseño") y aunque requiere registrarse, la herramienta es gratuita. Por algún motivo, xilinx no quiere que este paquete esté en los repositorios.
Por algún motivo, el ISE utiliza su propio entorno de qt. Es una versión vieja con muchas cosas extra estilo ubuntu que intenta escoger el mismo tema de qt que tenga el resto del sistema. Y falla catastróficamente si tienes un tema oscuro.
Así que no queda otra que eliminar nuestro tema mientras queramos usarlo. En mi caso, quitar una línea de .bspwmrc. ~~wal -R~~